在生物医学研究快速发展的今天,人工智能在蛋白质设计领域正掀起一场革命。Google DeepMind近日宣布推出其首个AI系统——AlphaProteo,该系统能够设计出高效的新型蛋白质结合体,为加速药物开发、疾病研究和更多领域的突破性进展提供了全新工具。
每一种生物过程都依赖于蛋白质之间的分子相互作用。这些作用如同钥匙与锁的配合,对于维持生命活动至关重要。此前的技术进步,如结构预测工具,已经大大深化了我们对蛋白质如何协作完成特定功能的理解,但仍未能直接创造出能够精准操控这些作用的新蛋白质。AlphaProteo的出现填补了这一空白,其通过AI生成与目标分子紧密结合的蛋白质,为生物学研究与医学进展提供了重要助力。
AlphaProteo的核心能力在于生成高强度的蛋白质结合体,这些结合体可用作广泛生物研究中的核心构件。例如,在此次测试中,AlphaProteo成功设计出了与血管内皮生长因子A(VEGF-A)结合的蛋白质,这是与癌症及糖尿病并发症相关的重要分子,这也是AI技术首次实现此类突破。
测试结果显示,AlphaProteo在七种目标蛋白上实现了卓越表现,其实验成功率远高于现有设计方法,结合强度更是提升了3到300倍。此外,对于新冠病毒刺突蛋白受体结合域(SC2RBD)这一关键靶点,AlphaProteo设计的结合体不仅阻止了新冠病毒及部分变异株对细胞的感染,还展现出了强大的实用潜力。
传统蛋白质结合体的设计流程往往极为耗时,需要反复的实验探索和优化以强化结合强度。而AlphaProteo凭借其通过AlphaFold和上亿条预测结构训练出的强大算法,能够快速生成符合要求的蛋白质结合体,大幅缩短了设计过程。不仅如此,AlphaProteo的输出蛋白质结合体在实验中的结合强度普遍优于现有设计方法,为研究人员节省了大量时间与资源。
为了确保AlphaProteo的可靠性,研究团队不仅进行了计算机模拟验证,还通过实验室测试进一步验证其性能。合作机构如英国弗朗西斯·克里克研究所参与了部分结合体的实验验证,确认了这些蛋白质结合体的生物学功能。例如,针对SC2RBD的结合体在抑制病毒感染方面表现优越,为抗疫研究和未来病毒防治提供了新可能。
尽管成果显著,团队也坦诚目前系统存在的局限性。例如,对于特定复杂靶点(如与类风湿性关节炎相关的肿瘤坏死因子TNF),AlphaProteo尚未成功设计出理想的结合体。研究团队将继续优化算法和拓展系统能力,以挑战更复杂的目标并克服现有瓶颈。
作为一项前沿科技,蛋白质设计在医药开发、疾病诊断、环境改善等领域蕴藏着巨大潜力。然而,伴随着技术进步,生物安全与伦理问题也需要被审慎对待。Google DeepMind携手外部专家,共同制定阶段性分享计划和最佳实践,以确保技术的负责任传播和使用。
未来,AlphaProteo将与全球科学研究者合作,应对生物学领域中的核心挑战。同时,Google DeepMind还计划将该系统应用于药物设计,并持续增强其算法性能与广泛适用性,为科学界提供更全面、更负责任的蛋白质设计工具。
如果您是一名生物学研究者,并希望参与AlphaProteo的测试计划,可联系alphaproteo@google.com进行注册。
AlphaProteo 的研发得益于 Google 的蛋白质设计团队、湿实验室团队及相关学术伙伴的合作,包括弗朗西斯·克里克研究所等机构。特别感谢 AlphaFold 团队,其提供的基础数据为系统训练与评估奠定了坚实基础。
从未有人如此贴近生命分子的奥秘,而AlphaProteo正以令人瞩目的进展,推动科学突破的边界。随着AI技术的迭代创新,我们期待这一系统为生物医学的明天带来更多可能性。
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能预测到AlphaProteo技术成为生物医学的里程碑,感觉正亲眼见证历史!